11月14日,重庆日报记者从重医附一院获悉,该院临床分子医学检测中心程伟教授团队研发了一种RNA快速原位成像新方法,能在1小时内完成肿瘤细胞/组织中RNA的原位检测,从而更好地揭示癌症发生规律,并对肿瘤精准分型。该研究成果日前发表在国际著名期刊《核酸研究》上,题目为《基于Cas12a 驱动链置换反应的RNA原位成像》。
RNA,即核糖核酸,是人体细胞遗传信息表达的载体。当细胞发生癌变时,相关RNA会出现异常的表达。通过原位成像方式检测肿瘤相关RNA表达,是揭示癌症发生规律和肿瘤精准分型的重要手段。“例如,使用传统的荧光原位杂交技术,可以检测鼻咽癌、淋巴瘤等肿瘤组织中EB病毒RNA的表达以辅助诊断。但检测时间一般在14小时以上,且存在操作繁琐、效率低等不足。”程伟介绍,链置换反应是一种基于核酸链结合解离的核酸检测技术,具有等温、无酶等优点,在生物医学领域具有广泛的应用前景。但链置换反应相对较低的催化效率和初始能量依赖性,导致其在RNA原位检测应用中面临重大挑战。
通过研究,程伟团队发现,Cas12a/crRNA 复合物可通过增加链置换反应初始反应能量和降解DNA单链副产物。基于此,团队发展了基于Cas12a助推链置换反应的快速RNA原位成像新方法。临床试验结果证明,该方法能在1小时内完成肿瘤组织中EB病毒RNA的原位成像检测,与临床常规使用的原位杂交方法结果完全一致。
业内人士认为,程伟团队研发的快速RNA原位成像新方法为临床分子诊断和RNA表达研究提供了一种全新的技术手段,具有广阔的应用前景。目前,该研究已获得国家自然科学基金、重庆市高校创新研究群体、重庆医科大学“揭榜挂帅”等项目资助。